いいえ、ほとんどの場合問題ありません。稀にrace conditionにより正しい校正値が見つからないことがあり改訂されたとの記述があり、校正値が妥当なら再度3.00でやり直す必要はありません。
(参照先)
i.MX 6/7 DDR Stress Test Tool
Stress Test Revision
3.00 Add i.MX 7ULP support in the GUI version
2.92 Minor correction with write leveling calibration code error
check to avoid a corner case of flagging an error when none have occurred.
2.91 Resolved issue with write leveling calibration code where a
race condition in the code may result in the calibration
routine not being able to find any delay values.