リンカファイルxxxx_Debug.ldで次の設定があり、FILLで0x00を指定しているため、未使用領域が0x00になります。

SECTIONS

{

     /* Image Vector Table and Boot Data for booting from external flash */

    .boot_hdr : ALIGN(4)

    {

        FILL(0x00)

        __boot_hdr_start__ = ABSOLUTE(.) ;

        . = 0x400 ;

        __flash_conf_hdr_start__ = ABSOLUTE(.) ;

FILLで指定する値を0xFFに変更することで未使用領域を0xFFに設定できます。

尚、xxxx_Debug.ldを編集する場合は、プロパティの設定変更が必要です。

プロパティの設定変更方法については、次のFAQを参照ください。