CCS起動後に下記の手順で設定を行ってください。

-Window-->Preferences
-General-->Startup and Shutdown-->Workspaces
-Prompt for workspace for startupにチェック。
-Applyボタンをクリック。

CCS起動時にワークスペース選択画面で「再び表示しない」をチェックした場合、

表示されなくなりますので、注意してください。