いいえ、TDMAを使用する設定とした場合に、TDMB_xxピンをGPIOピンに設定して使用することはできません。
ピンの設定はLS1043Aが起動する時にフラッシュからロードする512bitのRCW(Reset Configuration Word)で決定します。
これらのピンのRCW設定については、
LS1043Aリファレンスマニュアルの、3.4.5 External IRQ, QE, and GPIO1 signal multiplexing から、Table 3-7. IRQn signal configuration を参照してください。
Table 3-7. IRQn signal configurationにある、IRQ_BASEの設定に関係なく(Don't care)、「IRQ_EXT=001」と設定することでTDMインターフェースのピンがTDMAとTDMBに設定されます。
「IRQ_EXT=001」としてTDMA_xxと設定した場合には、TDMB_xxのピンに設定され、GPIOの設定にはできません。